Cita:
Iniciado por Sourcegeek 
¿Cómo está eso que los quieres quitar pero no puedes porque los necesitas?
¿Entonces te refieres a evitar esos caracteres pero no reemplazarlos?
Entonces usa preg_match con un condicional evitando los caracteres que deseas, si devuelve true, apareces un error que diga que no se permiten y ya.
no quiero borrarlos de la base de datos pero quiero que al hacer la busqueda no afecten en los resultados ejemplo si en la base de datos existe un numero 1.000 y se busque 1000 aparezca igual no se si se entiende