Código PHP:
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if (isset($_POST['seleccion'])){
$nombre = preparar($_POST['nombre']);
$contrasena = preparar($_POST['contrasena']);
$seleccion = $_POST['seleccion'];
}else{
echo'<form action="script.php" method="post">
usuario<input name="nombre" id="nombre" type="text" maxlength="100" size="30" />
contraseña<input name="contrasena" id="contrasena" type="password" maxlength="100" size="30"/>
1 <input type="checkbox" name="seleccion" value="1">
2 <input type="checkbox" name="seleccion" value="2">
3 <input type="checkbox" name="seleccion" value="3">
<input type="submit" name="Submit" value="Enviar">
</form>';
}?>