Importar contenido de directorios+php y mysql

[memt17]

######## Comparto aqui mi solucion ###############
<?php

include("../../require/conexion-db.php");
$link=Conectarse();

$aDatos = array();
$file = $_FILES['archivo']['tmp_name'];

$contenido = file("$file");
$i = 0;
foreach($contenido as $c){

$aDatos[$i]['id_orden'] = substr($c,0,9);
$aDatos[$i]['se'] = substr($c,10,10);
$aDatos[$i]['fecha_creacion'] = substr($c,20,8);
$aDatos[$i]['cod_ejecutor'] = substr($c,28,6);
$i++;
}
foreach($aDatos as $d){
$id_orden = $d['id_orden'];
$fecha_creacion = $d['fecha_creacion'];
$se = $d['se'];
$cod_ejecutor = $d['cod_ejecutor'];

$insertar = "INSERT INTO mitabla values(campo1, campo2,....)";
mysql_query($insertar, $link ) or die (mysql_error ());
}

?> Hasta ahi todo bien......... porque selecciono el archivo que cargo a la BD desde el formulario y se hace seleccionandolo uno a uno.

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Ahora lo que estoy buscando mejorar....... es no seleccionando el archivo tal cual lo estoy haciendo... sino que al clickear un link me cargue todos los archivos de los subdirectorios.

Explico mejor:

hacer que me lea una única ruta por ejemplo ("/base") donde se almacenan todos los directorios y cada uno de estos tienen subdirectorios pero solo uno de estos subdirectorios contiene los archivos que me interesan cargar a la BD.
No se si me explico, pero lo que deseo es una forma de automatizar la importacion de datos y cargar todos los archivos a la BD en un solo paso.

Agradezco enormemente su colaboracion.........

P.D. ya he buscado con la function.scandir y readdir, bien me arroja las rutas... pero como aplicarlo a lo que tengo