Hola El Menda!!!
Se me hace raro que ese sea el problema, ya que la politica del apt "deberia" se bajar la version mas nueva del paquete que encuentre en los fuentes indicados por el sources.list.
De todos modos, ¿has probado a comentar (poner un # al comienzo de la linea) la fuente de debian.org en tu sources.list?
Suerte,
un saludo,
kripton