No entiendes un lenguaje coloquial de informática.
Cuando decimos "basura" en este rubro nos estamos refiriendo a datos redundantes, campos innecesarios, código ineficiente, columnas excesivamente largas para los requerimientos del modelo, valores superfluos o mal formateados, etc.
Eso es basura desde el punto de vista de las BBDD.
También es basura el código de programación en los diferentes lenguajes, porque no agrega soluciones, ya que el SQL es independiente de ellos, y su presencia ensucia la lógica usada en las consultas.
¿Vas entendiendo?
Al decir que guardas basura en la base no me refiero a los datos, sino a lo innecesario: Rutas absolutas en las direcciones locales, JPGs almacenados en las tablas, cosas así.
1.000 fotos de 10 Kb, por ejemplo, le agregarían a la base 10 Mb, que pueden resolverse de modos simples. dos campos VARCHAR de 300 bytes, en una tabla con 10.000 registros, le suman 6 Mb, cuando la misma información tal vez podría necesitar apenas 1.5 MBytes... dependiendo del tipo de dato.
Otro ejemplo: Si tienes una tabla con un campo opcional que suma 1 Kb por vuelta, podrías estar sumando 5 MB de datos vacíos, si no se usa todas las veces; y eso es el resultado de falta de normalización.
Todo suma. La basura o espacio desperdiciado también.
¿Ahora entiendes?
Como ya te dije:
Cita: ¿Tienes tablas con columnas BLOB donde guardes fotos o documentos en la tabla? Sacalos de allí. Es una mala práctica.
¿Tienes muchos campos VARCHAR demasiado largos para los datos que guardan. Achícalos.
¿Tienes índice que no invocas? Elimínalos.
Verifica la estructura y mira si tienes por donde optimizar.
Respecto a la cuenta, me refiero al hosting. Todos ellos tienen diferentes tipos de ofertas de cuentas para los usuarios. Si tu límite es de 50 Mb, pues contratales otra que te de mas. ¿No te parece evidente?