Probá así:
Código PHP:
var elementoScrolleable=document.getElementById('tucapa'),
flecha1=document.getElementById('tuflecha1'),
flecha2=document.getElementById('tuflecha2');
if(elementoScrolleable.scrollHeight<=elementoScrolleable.clientHeight)){//reemplazar Height por Width si el scroll es horizontal
flecha1.style.visibility=flecha2.style.visibility='hidden';
}else{
flecha1.style.visibility=flecha2.style.visibility='visible';
}