Lo que deberias haber hecho es que ejecutar en el servidor los
ALTER TABLE que ejecutaste en local.... y asi mantener iguales las estructuras...
No se si existe algo que te lo haga automaticamente, pero manualmente tendrías que compara la definicin de cada una de las tablas en la version local y la del servidor y construir los
ALTER TABLE que hagan falta... no tines por que dañar los datos si lo haces bien....