Casualmente yo utilizo la misma Clase, que es realmente muy buena. La forma en que inserto datos en celdas es esta
Código PHP:
Ver original$objPHPExcel->setActiveSheetIndex(0)->setCellValueByColumnAndRow($columna, $fila, $valor);
Tené en cuenta que la primer columna es la 0, y la primer fila es la 1.
Saludos!