Especifica! de cuál distruibución de Linux estamos hablando.
Por ejemplo si se trata de Ubuntu Linux.
Google: Como reparar una instalacion corrupta en Ubuntu
Google: Ubuntu Reparar los errores del sistema de archivos
Google: Desinstalar Ubuntu y dejar solo Windows
Además deberías comprobar si el equipo funciona normalmente iniciando desde un disco de instalación de sistema operativo, o la opción LiveCD de la distribución de Linux instalada si se incluye, o desde cualquier otro Bootable CD con aplicaciones/herramientas LiveCD, o cualquier BootCD con versiones LiveCD de Linux o Windows, o cualquier LiveCD de Windows o Linux.
Por cierto que el subforo o foro especifico para consultas de Linux o equipos que usan Linux es este
http://www.forosdelweb.com/f41/