Ese es un corportamiento propio de las capas relativas. Googleá "flujo de documento css"
En este link podes ver que posicionamiento aplicar según tu diseño (que por otra parte solo vos estas viendo)
http://www.librosweb.es/css/capitulo5.html
Supongo que lo mejor será que trabajes con un contenedor relativo y anides cajas absolutas (para que las cotas de éstas dependan de la esquina superior izquierda (0,0) del contenedor).
Saludos.