Todo lo que tenga que ver con logica lo debes hacer en los modelos. Puedes indicar una variable en el método para que el controlador indique la ruta a borrar.
   
Código PHP:
Ver original<?php
class Foo
{
    public function fooBar($url)
    {
        //logica para borrar
    }
}
  
En el controlador algo como   
Código PHP:
Ver original<?php
$obj = new Foo();
$obj->fooBar('/ruta/hacia/el/archivo/para.borrar');
  
Ademas la librería es como un tipo de modelo, solo que almacenas lo que vayas a usar en toda la aplicación.