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Iniciado por Juan Ca 
Si se ha eliminado todo el contenido antiguo y ya no existe, y no existe contenido nuevo, es decir, que no has cambiado a otras url, entonces deberías poner en cada carpeta un archivo con error 404 para dar cuenta a Google. Además, también podrías utilizar la acción "Disallow" del robots.txt poniendo las url que te muestra Google y ya no existe.
y como les voy a poner el error 404 si las carpetas y páginas ya no existen? las vuelvo a crear?