mostrar error con extensión no váilda de Uploadify

[Naahuel]

Usá el método de los string toLowerCase(); para convertir a minúsculas todo y quitá las mayúsculas del filtro:

Código Javascript:

'onSelect'    : function(event,ID,fileObj) {
    var filter = /(.jpg|.jpeg|.png|.gif)/;
    // utilizamos test para comprobar si el parametro valor cumple la regla
    if(!(filter.test(fileObj.type.toLowerCase()))){
        alert('solo se aceptan archivos .jpg,jpeg,.png y gif');
        return false;
    }/*if*/
},
 

Debería funcionar.