Como demonios hago esta consulta xD

[gnzsoloyo]

Allí, infortunadamente, la cosa se complica.
Hay varias formas de lograrlo, pero todas o casi todas requieren llamar dos veces a la tabla Filtros, asociandole un alias diferente a cada una, para poder ubicar las coincidencias.
De todos modos, hay una solución mas o menos sencilla, si lo que necesitas es sólo el Local relacionado con esos filtros y no los datos vinculados a los filtros:

Código MySQL:

SELECT * 
FROM 
    locales L
    INNER JOIN rel_locales_filtros RLF ON L.id = RLF.idl
    INNER JOIN filtros F ON RLF.idf = F.id
WHERE 
    F.id IN(1, 9)
GROUP BY L.titulo 
ORDER BY L.id DESC
HAVING COUNT(*)=2;
 

Esto devolvería aquellos registros donde haya dos coincidencias al menos. Siendo que no puede repetirse una misma coincidencia de un ID de filtro más de una vez, la otra forzosamente correspondería al otro filtro.