Por favor reduce el código al mínimo, postea sólo lo que te da problemas. Si nunca tienes cupos es porque $alerta siempre vale 0:
Código PHP:
Ver originalif ($alerta==0)
{
echo "<center><font color='red'><h4><font face='Times New Roman, Times, serif'>¡¡¡ Aviso del Sistema !!!</font></h4></font color></center>";
echo "<center><font color='red'><h4><font face='Times New Roman, Times, serif'>¡¡ No existen cupos para $Grado Grado cree otra Sección!!</font></h3></font color></center>";
echo "<center><font color='red'><h4><font face='Times New Roman, Times, serif'>¡¡ Por Favor dirija al Inscrito a otra Sección disponible !!</font></h3></font color></center>";
echo "<center><font color='red'><h4><a href='principal.php'><font face='Times New Roman, Times, serif'>| Regresar |</font></a></h4></font color></center>";
return;}
else
{
comprueba el valor de alerta con echo a ver qué sale, saludos.