detener un único movie click

[Bandit]

Estás confundiendo la Línea de tiempo principal (escenario) donde haz puesto todos tus MC, con la Línea de tiempo del MovieClip que quieres detener, ya que son 2 cosas muy distintas.
El stop(); funciona en AS2 como en AS3 de la misma manera.
Lo que tú haz hecho es colocar el stop(); en un frame de la línea de tiempo principal, por eso se te detiene toda la película en ese frame, tampoco debes de seleccionar el MC para colocar el código porque en AS3 no es posible hacer eso.
Parece que no sabes como ver la Línea de tiempo del MC, es muy simple de hacerlo, aquí las 2 formas de ingresar al MC:
1.- Simplemente en el escenario en ese MC haz doble clic y te abrirá el contenido de dicho MC.
2.- En la Biblioteca haz clic con el botón derecho sobre el nombre del MC y activas Editar.
Con cualquiera de esos 2 modos verás la Línea de tiempo del MC y allí selecciona el frame donde quieres que se detenga y presiona la tecla F7 y en el Panel de acciones escribes el stop();

Espero haberte sido de ayuda.