El htaccess si puede contener caracteres como ñ á, etc, pero recordá guardarlo como utf-8 sin BOM.
Ejemplo:
http://foros.emprear.com/css/tooltips/
la palabra código (acentuada) para la descripción de tooltipis.phtml proviene del propio htaccess
Ahora lo que es muy probable es que tu servidor no esté preparado para soportar esos caracteres en las urls, que ya es algo completamente distinto.
Para el link
http://foros.emprear.com/css/tooltips/tooltips.phtml que está en la carpeta anterior
RewriteRule ^España$ /css/tooltips/tooltips.phtml [L]
Proba de ir a
http://foros.emprear.com/España
SAludos