Problema con INNER JOIN

[gnzsoloyo]

Parse error: syntax error, unexpected T_ENCAPSED_AND_WHITESPACE, expecting T_STRING or T_VARIABLE or T_NUM_STRING in archivo.php on line 89.

Este no es un mensaje de error de MySQL, sino de PHP. Es decir que el problema no se está manifestando en el MySQL, sino en la ejecución del script.
Revisa cómo estás almacenando o usado la sentencia de SQL en el contexto de PHP.

Fuera de eso, la consulta en sì es correcta:

Código MySQL:

SELECT 
    tiendas.id, 
    tiendas.nombre, 
    tiendas.poblacion_id, 
    tiendas.poblacion, 
    tiendas.direccion, 
    marcas.id_tiendas, 
    marcas.id_marcas 
FROM tiendas  
    INNER JOIN marcas 
WHERE 
    tiendas.id = marcas.id_tiendas 
    AND marcas.id_marcas=$_GET['marca'] 
    AND tiendas.poblacion_id=$_GET['pobl']
 

Habría que ver si las variables de entrada tienen algo o no, o incluso si existen en el contexto de PHP.
Pero eso es tema ajeno a este foro. Te sugiero consultar en el Foro de PHP.