En el inner join debes poner la clausula ON.
Si las variables GET son alfanuméricas debes ponerlas entre comillas como te pongo en el ejemplo, si son numéricas quítale las comillas simples.
Código PHP:
"INNER JOIN marcas
ON
tiendas.id = marcas.id_tiendas
WHERE
marcas.id_marcas='".$_GET['marca']."'
AND tiendas.poblacion_id='".$_GET['pobl']."'"
saludos,