Hola ... despues de mucho buscar lo logre.
Lo que debes hacer es usar una configuracion diferente ... para esto debes crear un archivo de configuracion con los datos que quieras ... ejemplo:
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<barcode>
<ean-128>
<height>15mm</height>
<module-width>0.21mm</module-width>
<check-digit-marker>_</check-digit-marker>
<group-separator>*</group-separator>
<template>(415)n12+cd(8020)n-13(3900)n-6(96)n8</template>
<quiet-zone enabled="true">10mw</quiet-zone>
<human-readable>
<placement>bottom</placement>
<font-name>Helvetica</font-name>
<font-size>6pt</font-size>
<omit-brackets>false</omit-brackets>
</human-readable>
</ean-128>
</barcode>
Luego llamas el barcode4j usando el archivo de configuracion, yo estoy usando el .bat asi ..
barcode.bat -o code.png -f png -c config.xml "41577071739810088020030381777905*3900097029*96201 20524"
El truco ahora esta en * si ves en la configuración en el atrib group-separator he puesto * asi que debes usar este mismo en el mensaje que estas enviando ...