Fijate si esto te funciona.
Código PHP:
Ver originalfor($i=0; $i<count($_POST["permiso"]); $i++) {
$sql="update admin_per set permiso='".$_POST["permiso"][$i]."' where id='".$_POST["id"][$i]."'";
{
echo "<script language='javascript'>alert('Permisos modificados correctamente');</script>";
}
}
Espero sirva, saludos.