Cita: Mensaje Original por Helbira Prueba estas tres cosas:
DELETE * FROM prueba WHERE Id IN('1') Esto no debe ser a menos que tu campo sea alfabético cosa que realmente no creo
o bien:
DELETE * FROM prueba WHERE Id = 1 Esto no debe ser por que solo te va a borrar un registro
O bien:
DELETE * FROM prueba WHERE Id = '1' Esto tampoco debe ser
Suerte 
P.D.: Vi tus MP un poco tarde.. estuve de vacaciones 
DELETE * FROM prueba WHERE Id IN(1) El SQL que se generó es correcto, el error debe estar por otro lado.