JenderXd.
Lo primero que se me ocurre decirle es que separe el HTML del PHP, es mas ordenado y es mas eficiente.
ahora para la consulta pruebe con esto.
Código:
SELECT al.* FROM alumno al, grado g, seccion_grado sg WHERE g.id_ano = sg.id_ano AND sg.id_alumno = al.id_alumno AND g.ano = "año a buscar"
Repasando mas acerk de SQL ya podra usar JOIN, GROUP BY y otros comandos mas utiles y aun asi yo le diria que acomodara mas las tablas, Tiene algo que no me cuadra de mucho con eso de crear una tabla solo para un año.
Hagale y responde.