Entonces deben ser los datos en la base de datos, porque al utilizar INNER JOIN los datos tienen que ser correspondientes por ejemplo:
Código PHP:
Ver originalTabla Alumno:
id_alumno | nombre
1 | carlos
2 | jose
3 | juan
Código PHP:
Ver originalTabla Grado:
id_ano | ano
1 | 2011
2 | 2012
Tabla Seccion:
Los resultados que obtengas dependen de la siguiente tabla
Código PHP:
Ver originalTabla seccion_grado:
id_ano | id_seccion | id_alumno
1 1 1
1 4 2
2 2 3
Si hacemos una consulta, sólo nos mostrará 2 alumnos, porque no existe una sección con id=4
por lo cual los id que se inserten en esta tabla deberian de ser válidos
si quieres que te muestre los datos aunque no haya relación
podrias probar con LEFT JOIN o RIGHT JOIN