La respuesta que te dieron es válida pero no óptima. Se puede solucionar, tal y como te propone patriciomase con una sola consulta a la db, así haces menos consultas a la db y simplificas tu código.
Código PHP:
$consulta= mysql_query("SELECT t2.id FROM tabla_1 t1 left JOIN tabla_2 t2 ON t1.id = t2.id_tabla where t1.username = '$username'",$conexion);
//aqui ya tienes disponible el array $consulta, para manipularlo con foreach como quieras. Te será mas versatil que las variables.
echo $consulta[0]["id"];
echo $consulta[1]["id"];
Saludos.