Problema de compatibilidad entre explorer y chrome.

[kseso?]

Comience por pasar sus códigos por el validador, tanto html como css.

Estas situaciones suelen darse por una cuestión de tamaños de las cajas.
También compruebe que no haya desbordamientos (overflow).
Y si puede, depure su html y utilice la sintaxis y atributos permitidos por el doctype que declara.