En general las herramientas suelen evaluar si tienes una cuenta popular por el nombre de la cuenta vs nombre del dominio... no las he visto muy fiables hasta ahora. En cualquier caso Google no evalua la cuenta de la red social sino la parte del "movimiento" en las redes sociales hacia tu web visible. 3.000 seguidores fieles en un grupo facebook oculto, valen tanto como un grupo sin seguidores.
Aunque no tengas cuenta en Twitter si muchos usuarios hablan de la web y la enlazan, para Google tendrás un punto a favor.
Aunque si soy sincero cada vez valoro menos las redes sociales por lo que mejoran las posiciones en las SERP's y más por el tráfico que aportan.