editar archivo .conf de linux desde java webstart

[lap88]

Hola a todos compañeros
En esta ocasion tengo una aplicacion que corre con java SE web start (se ejecuta en el cliente pero los recursos los recupera desde un servidor linux/debian)
necesito desde la aplicacion editar un archivo .conf que se encuentra en una carpeta del directorio /etc de linux, pero no tengo idea como accederle ya que no es publico como los archivos que se encuentran en /www. Creo que tiene q ver algo con usuarios y permisos de apache, pero no estoy seguro porque mis conocimientos en linux son muy escasos

muchas gracias de antemano por la ayuda!