Se me ocurre que es probable que si la ruta en la aplicación luego se crea en forma dnámica, es posible que lo que estén almacenados sean sólo los nombres de los archivos, ya que la cadena de la ruta inicial podría ser sólo algo como "../", que el sistema agregase al inicio.
En definitiva, si en la tabla
debería aparecer la ruta a la carpeta personal, más el nombre del archivo, yo buscaría precisamente por aquellos archivos que carecen de ruta.
Una forma de hacerlo "a mano", sería ubicar el nombre de uno de los archivos y luego buscarlo dentro de la tabla con un
.
Eso podría devolverte todas las apariciones del mismo nombre, y donde no vea una ruta específica, es que es raíz.
De todos modos yo comenzaría verificando los scripts, para ver cómo construyen la ruta.