comparar codigo

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Hola amigos , veran tengo un problema resulta que estoy haciendo un escaner a un directorio el cual me guarda los resultados en una variable despues copio todos los archivos en un directorio temporal y ahora necesito comparar si los codigos son iguales y no han sido modificados , pues... no doy con ello , se puede comparar los tamaños para ver si fueron modificados o incluso la fecha de modificacion del archivo ¿creo? si no es asi diganmelo. que mas comparaciones podria hacer si esque no se puede comparar el codigo que es la pregunta en cuestion, de no poderse necesito otros caminos que seguir