Cita: ...lo que necesito es que me deje los ultimos 3 creados y que no se guie por la fecha ....
Si no seguia por la fecha por que se va a guiar....
time() supongo que quieres decir que no se guie por la fecha actual....
Solo se me ocurre que crees un array con los nombres ($f) y la fecha (filemtime('respaldo/'.$f)), ordenes ese array por fecha descendente y elimines desde i=3 al final (unlink('respaldo/'.$f); paraca cada elemento del array desde 3 al final).