Utilizar scroll, lightbox de jQuery es bueno para posicinar una Web?

[ceaped]

Buenos días para todos
estoy construyendo un sitio Web en el cual utilizo jQuery, para galería de fotos, toolTip, acordeón, scroll entre otros.
La utilización de esto hacer perder SEO?
Es mejor poner los textos lineales hacia abajo sin scroll?
Hasta que punto es bueno utilizar jQuery para dar un mejor diseño, diagramación y forma de navegar, hacer una pagina plana?. No utilizo Flash por la misma razón que los buscadores no lo identifican tan bien y mejor utilizo jQuery pensando que si.

Gracias por su ayuda