si ese es tu proble puedes modificar session.name y session.cookie_domain en modo de ejecucion para asegurar el perfecto funcionamiento ya que todas las sessiones seran creadas con el nombre de tu dominio
http://php.net/manual/es/function.session-name.php http://www.php.net/manual/es/session....cookie-domain
session_name("www.ejemplo.com"); // no tiene por que ser tu dominio
session_cookie_domain("www.ejemplo.com");