Probablemente lo tienes programado como usuario cPanel y como root?
Con este comando puedes ver todos los crontab de todos los usuarios
Código:
for user in $(cut -f1 -d: /etc/passwd); do echo $user; crontab -u $user -l; done
Adicionalmente mira que tienes en /etc/cron.d y los otros en /etc/cron.xxxx