En realidad cualquier sistema serio no debería involucrar javascript, a excepción de Ajax, ya que seguirías validando via el php.
Aqui te dejo un sistema de loguin/logout sencillo, quizás puedas extraer alguna info que te oriente.
http://foros.emprear.com/php/sistema-login/
inicia en loguin.php
Saludos