Lo de las validaciones del form_validator me pareció increible, tienen el $_POST hardcodeado (como hacen en muchos otros lados) ahí mismo, imposible usarlo de otra manera sin recurrir a horribles hacks:
https://gist.github.com/3451557
Otra mención para el load de libraries que hace, las instancia y las asigna al FrontController, con lo cual no podes hacer un load de una clase abstracta.
La sopa de funciones globales que tiene, la odio. Los helpers son excesivamente básicos.
Después me acordare otras cosas más.