Bueno, yo lo hago del mismo tamaño que va a tener la web, así tengo una idea más clara de como va a quedar.
Mira, en esta página que te pongo hay plantillas prediseñadas que vienen con su correspondiente modelo en photoshop. Igual te sirven para orientarte.
http://www.elated.com/pagekits/index.shtml
Aquí te dejo otra web hecha con un sistema parecido al que querías utilizar, una única imagen mapeada. También puedes bajártela para ver como la hicieron.
http://www.photonica.com/home/home.asp .
Saludos.
