1. ¿Para que deseas ejecutar dicho comando?
Es evidente que se trata de la función mkdir, y para ser claro, php provee de dicha función out-of-the-box.
http://php.net/mkdir
2. La llamada a la función "ejecutarComando" la tienes colocada en tu código como si fuera Javascript
Debes aprender la diferencia entre cliente y servidor antes de comenzar a hacerte ilusiones oṕticas, php se ejecuta desde el servidor y tu intentas como si fuera posible llamar el código desde el navegador (cliente).
Eso es totalmente incorrecto.
3. Está bien, dices que intentas hacer algo, incluso muestras código ¿y luego?
A ciencia cierta nadie sabe si lo que haces está bien o no, si deseas recibir ayuda de la mejor manera debes expresarte como debe ser.
Cualquiera leería tu tema y pensaría "¿y entonces cual es el problema?, yo sólo veo código..."
Te invito a leer las normas del foro antes de continuar, gracias.