Hola, intentare aclararte algunas dudas desde mi humilde experiencia y los años que llevo usando Adwords:
- En primar lugar ten en cuenta que la competencia no lo es todo. Intervienen muchisimos factores a la hora de calcular el CPC de cada palabra como la calidad de la pagina de destino, calidad del anuncio, historico de CTR de la cuenta, historico de CTR de los anuncios, y los mismos factores para la competencia que esten pujando por esa palabra entre otras muchas cosas.
Deduzco que habras segmentado todas tus palabras para la campaña de branding en una campaña separada de las demas, de no ser asi y si se encuentra en un grupo de anuncios tendrias que revisar este punto, asegurate que la pagina de destino y el texto del anuncio sean relevantes, etc.
- Respecto al tema de Adwords y Analytics, nosotros tambien tuvimos algunos problemas ya que habia clicks que no se veian reflejados y las discrepancias eran abismales. Muchas veces la competencia se dedica a hacer clicks indiscriminadamente en los anuncios mediante bots o scripts. Dichos clicks obviamente no se ven reflejados en Analytics puesto que este recoge los datos mediante cookies, y si dichas cookies no estan seteadas pues no hay manera de rastrear estos clicks por lo que encontraras diferencias muy grandes entre Adwords y Analytics. Nosotros lo que hicimos fue registrar el referer de cada visita proveniente de Adwords y si encontrabamos clicks indiscriminados, bloqueabamos esa IP en los anuncios. Seguro que hay alguna forma mejor de hacerlo pero podrias empezar por ahi. Tambien podrias comparar estas visitas con los logs de tu server e instalar alguna otra herramienta de monitorizacion de estadisticas.
El problema es que Goole tiene sistemas para bloquear esos clicks pero falla mas que una escopeta de feria, asi que hay que estar pendiente de ello constantemente.
Ademas, piensa que hay una gran cantidad de usuarios que navegan sin javascript o cookies habilitadas por lo que esos datos no apareceran reflejados.
Esta claro que tiene muchos puntos flacos pero al menos te ayuda a tener una vision global del trafico que llega a tu pagina.
Te recomiendo que te pases por el foro de la comunidad de adwords:
http://es.adwords-community.com
ya que ahi te podran asesorar mucho mejor.
Saludos.