Si no me equivoco tu error es que intentas coger datos de una tabla que está en la base de datos anterior y como has abierto otra conexión no lo coge de esta última..
Puedes seleccionar datos de la segunda base de datos con una sola conexión(siempre que el usuario al que hayas conectado tenga privilegios en la otra base de datos).
Para hacerlo debes hacer nombredelabasededatos.tabla
Ejemplo:
Código:
SELECT * FROM base2.usuarios WHERE username = 'karma274';
Ahí nos seleccionaría de la tabla usuarios el usuario con el nombre karma274 de la base de datos base2.. mientras que por ejemplo, en nuestra conexión MySQL, estaríamos conectado a la base de datos llamada base1..
Prueba con eso, creo que solucionará tu problema.