buenas, pus tus checkbox tentran el atributo value="1" cundo envias el formulario preguntas por el valor del checkbox y lo guardas en la base de datos.
para que salga marcado harias algo asi:
Código PHP:
Ver originalEcho('<Input Type="checkbox" value="1" Id="CHK'.$Fila[Id].'" ');
if($Fila['Check']==1){Echo('Checked');}
Echo(' />');