Eso se puede hacer también como yo he dicho, con dos UPDATES
Código SQL:
Ver originalUPDATE pagos SET baja = 1
WHERE CONCEPTO = 'ENERO'
AND FECHA_SALDADA < DATE_FORMAT(FECHA_SALDADA, '2013-%m-%d')
UPDATE pagos SET baja = 2
WHERE CONCEPTO <> 'ENERO'
OR FECHA_SALDADA >= DATE_FORMAT(FECHA_SALDADA, '2013-%m-%d')