Hola
Para compatibilizar IE con HTML5 y CSS3
Puedes comenzar leyendo esto:
http://ksesocss.blogspot.com/2012/05...-explorer.html
Y continuar con el video de memoadian:
http://www.cursosdelwebmaster.com/20...-practico.html
Básicamente, para que funcione nav y demás etiquetas puedes utilizar librerias javascript como selectivizr o similares.
Busca en San Google, hay mucho material, yo sólo te mostré los que consideré más faciles y rápidos de comprender, pero seguro que habrá otros.
Saludos