Considerando que una versión que termina en "b" implica una versión
beta, yo me inclinaría a pensar que se trata de bugs que fueron resueltos en las siguientes versiones...
Es normal que una versión beta sólo sea para testers, y ponerla en ambientes productivos en un error muy grave.
Yo te dría que ni te molestes en averiguar por qué pasa. Directamente instala al menos la versión siguiente (5.0.67) que si era estable, y olvídate del asunto. Es irrelevante y si el bug fue solucionado no tiene sentido preocuparse por él.
Ve a la pagina oficial:
http://downloads.mysql.com/archives.php?p=mysql-5.0