acotando el problema se llega a la solución,,,,,,
de momento sigo sin solucionarlo, pero es evidente que de mysql no es,,, ya que haciendo echos, y printfs, por pantalla no me salen bien los acentos y caracteres especiales,, pero si en fichero,,,
tiene que ser del servidor o de PHP, he puesto todas las opciones posibles, con SET_NAMES, y variables en apache, pero sigo sin tener una solucion,,,,
