podrias hacer de tu consulta una "tabla virtual" algo asi podria funcionarte
Cita: SELECT mitabla.total_habitantes / Aliastabla.AliasCount
FROM mitabla, (SELECT count(*) AS AliasCount FROM personas p , comuna c , enfermedad e
WHERE p.cod_comuna=c.cod_comuna AND
p.enfermedad=e.enfermedad) Aliastabla