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Iniciado por JManuelMV 
Gracias a ambos por la respuestas, en cuanto la opción que voy a utilizar son el de subcarpetas ya que el cliente para quien que estoy desarrollando el sitio lo quiere lo mas pronto posible, y lo de crear las subcarpetas me parece la opción más rápida.
En cuanto el desarrollo no estoy usando ningún CMS, y ahí mi duda es si dentro de la subcarpeta realizar la copia de las imagenes, css y js, o simplemente redireccionarlos al directorio principal?
Aquí también tienes diferentes opciones.
La mejor:
En un subdominio: static.ejemplo.org/css
Lo normal:
En una carpeta raíz o derivados: ejemplo.org/css
Dependiendo del presupuesto. La primera es recomendada ya que las paginas se cargan mas rápido... no mucho, pero algo mas. Pero la dificultad es un poco mas alta.
Un saludo!