Entonces es pura cuestión de CSS... Te sugiero que aclares bien cual es el problema y veas cual es el código que te genera el conflicto y luego preguntes en el foro de
CSS donde te podrán ayudar mucho mejor.
Por ahora si te puedo adelantar que será bueno que incluyas en tu web
CSS3 Reset y
HTML5Shiv, que te ayudarán a que se vea bien en todos los navegadores, específicamente en versiones antiguas de IE.
Saludos.