GROUP_CONCAT agrupa en una sola cadena todo lo que encuentre,
en cada registro que se agrupe, por lo que no hace distinciones de distintos a menos que específicamente se lo indiques:
Código MySQL:
Ver original P.*,
A.presu2_id,
B.prodbun_tipo,
B.prodbun_numero,
B.prodbun_id
LEFT JOIN prod_bundle B
ON P.presu_id
= B.prodbun_numero
AND B.prodbun_tipo
=0 AND A.presu_artiid
= B.prodbun_id
P.presu_id =1
A.presu2_id, B.prodbun_id