Problemas Con GROUP BY

[gnzsoloyo]

¿Estás seguro de estar usando lo que yo te postee?
Mira, te paso la captura de consola de lo que yo ejecuté, y voy a suprimir solamente las columnas innecesarias:

Código MySQL:

mysql> SELECT
    ->     GROUP_CONCAT(DISTINCT A.presu_artiid)AS arti_id,
    ->     GROUP_CONCAT(DISTINCT B.prodbun_artiid)AS bundlearti_id,
    ->     GROUP_CONCAT(DISTINCT B.prodbun_cantidad)AS bundle_cantidad,
    ->     B.prodbun_tipo,B.prodbun_numero,B.prodbun_id
    -> FROM presupuestos P
    ->     INNER JOIN presupuestos2 A ON P.presu_id=A.presu2_id
    ->     LEFT JOIN prod_bundle B ON P.presu_id=B.prodbun_numero AND B.prodbun_tipo=0 AND A.presu_artiid=B.prodbun_id
    -> WHERE  P.presu_eliminado=0  AND P.presu_id =1
    -> GROUP BY A.presu2_id;
+-------------------+---------------+-----------------+--------------+----------------+------------+
| arti_id           | bundlearti_id | bundle_cantidad | prodbun_tipo | prodbun_numero | prodbun_id |
+-------------------+---------------+-----------------+--------------+----------------+------------+
| 5,7,49,1361710188 | 5,7           | 1,2             |         NULL |           NULL |       NULL |
+-------------------+---------------+-----------------+--------------+----------------+------------+
1 row in set (0.00 sec)
 

Como puedes ver, no repite datos, en tanto el gROUP_CONCAT() tenga el DISTINCT...
Estoy usando tu propio esquema y datos pasados.